POD產品說明：1. 本產品為按需印刷（POD）圖書，實行先付款，后印刷的流程。您在頁面購買且完成支付后，訂單轉交出版社。出版社根據(jù)您的訂單采用數(shù)字印刷的方式，單獨為您印制該圖書，屬于定制產品。2. 按需印刷的圖書裝幀均為平裝書（含原為精裝的圖書）。由于印刷工藝、彩墨的批次不同，顏色會與老版本略有差異，但通常會比老版本的顏色更準確。原書內容含彩圖的，統(tǒng)一變成黑白圖，原書含光盤的，統(tǒng)一無法提供光盤。3. 按需印刷的圖書制作成本高于傳統(tǒng)的單本成本，因此售價高于原書定價。4. 按需印刷的圖書，出版社生產周期一般為15個工作日（特殊情況除外）。請您耐心等待。5. 按需印刷的圖書，屬于定制產品，不可取消訂單，無質量問題不支持退貨。【編輯推薦】POD產品說明：1. 本產品為按需印刷（POD）圖書，實行先付款，后印刷的流程。您在頁面購買且完成支付后，訂單轉交出版社。出版社根據(jù)您的訂單采用數(shù)字印刷的方式，單獨為您印制該圖書，屬于定制產品。2. 按需印刷的圖書裝幀均為平裝書（含原為精裝的圖書）。由于印刷工藝、彩墨的批次不同，顏色會與老版本略有差異，但通常會比老版本的顏色更準確。原書內容含彩圖的，統(tǒng)一變成黑白圖，原書含光盤的，統(tǒng)一無法提供光盤。3. 按需印刷的圖書制作成本高于傳統(tǒng)的單本成本，因此售價高于原書定價。4. 按需印刷的圖書，出版社生產周期一般為15個工作日（特殊情況除外）。請您耐心等待。5. 按需印刷的圖書，屬于定制產品，不可取消訂單，無質量問題不支持退貨。【編輯推薦】新定價鏈接：R語言及Bioconductor在基因組分析中的應用從事統(tǒng)計分析或者生物信息學研究的工作人員和研究生，另外一類讀者是其他領域的計算機應用人員【內容簡介】本書是國內*本系統(tǒng)介紹R語言及Bioconductor軟件包的圖書。R是一種計算機程序設計語言，也是一個開放式的軟件開發(fā)平臺。R具有強大的數(shù)學統(tǒng)計分析和科學數(shù)據(jù)可視化功能，提供各種數(shù)據(jù)處理、統(tǒng)計分析及圖形顯示工具。軟件研究人員可以在R這個開放平臺上不斷擴充R的功能，開發(fā)出面向特定應用的軟件。Bioconductor就是一個基于R的、面向基因組信息分析的應用軟件集合。Bioconductor的應用功能主要是以包的集成形式呈現(xiàn)在用戶面前，它提供的軟件包中包括各種基因組數(shù)據(jù)分析和注釋工具，其中大多數(shù)工具是針對基因芯片或DNA微陣列數(shù)據(jù)的處理、分析、注釋及可視化。同時，Bioconductor還提供許多與DNA微陣列相關的數(shù)據(jù)包。本書分為上下兩篇，分別介紹R和Bioconductor軟件包，介紹Bioconductor在基因組分析中應用。【目錄】前言上篇 R語言第1章 R語言簡介1.1 平臺1.2 R語言的發(fā)展簡史1.3 R語言和統(tǒng)計學1.4 運行R語言的環(huán)境及安裝1.5 交互式使用R語言第2章 R語言的基本數(shù)據(jù)結構2.1 向量的賦值2.2 向量的基本運算2.3 構造向量2.4 邏輯向量2.5 字符向量2.6 復數(shù)向量2.7 獲取向量子集和修正向量子集2.8 常量第3章 R語言對象3.1 對象的基本屬性3.2 改變對象的長度3.3 獲取對象的屬性3.4 獲取對象類第4章 分組因子4.1 分組因子4.2 聚集計算4.3 排序第5章 數(shù)組和矩陣5.1 定義數(shù)組5.2 數(shù)組子集操作5.3 構造數(shù)組5.4 數(shù)組計算5.5 矩陣5.6 數(shù)組矩陣合并5.7 定義數(shù)組的操作第6章 數(shù)據(jù)列表和數(shù)據(jù)單6.1 數(shù)據(jù)列表6.2 構造數(shù)據(jù)列表6.3 數(shù)據(jù)列表操作6.4 數(shù)據(jù)單第7章 導入導出數(shù)據(jù)7.1 高級函數(shù)7.2 低級函數(shù)7.3 命令臺輸入輸出以及格式化7.4 使用R語言內含的數(shù)據(jù)集第8章 組合表達式和控制語句8.1 組合表達式8.2 控制語句第9章 函數(shù)9.1 排序的例子9.2 定義新的操作符9.3 參數(shù)名和參數(shù)缺省定義9.4 ‘...’形式的參數(shù)（虛參）9.5 函數(shù)和變量的作用范圍9.6 類、通用函數(shù)和面向對象9.7 調試9.8 操作符號的優(yōu)先級第10章 包10.1 標準包10.2 擴展包和CRAN10.3 包命名空間10.4 R語言中常用的包第11章 R語言中的統(tǒng)計11.1 R語言中的概率分布11.2 從離散數(shù)據(jù)集分析概率分布特性11.3 回歸分析第12章 圖形函數(shù)12.1 高級圖形命令12.2 低級圖形函數(shù)12.3 與圖形進行交互12.4 利用圖形參數(shù)12.5 圖形參數(shù)列表12.6 設備驅動12.7 動態(tài)圖形下篇 Bioconductor及其應用第13章 Bioconductor與DNA微陣列數(shù)據(jù)處理13.1 Bioconductor簡介13.2 DNA微陣列13.3 微陣列數(shù)據(jù)處理與分析13.4 Bioconductor開發(fā)背景13.5 Bioconductor各種包的分類介紹第14章 Bioconductor的使用14.1 Bioconductor的獲取和安裝14.2 Bioconductor快速入門14.3 Bioconductor應用實例第15章 數(shù)據(jù)庫訪問15.1 Rdbi軟件包15.2 RdbiPgSQL軟件包15.3 SAGElyzer軟件包第16章 圖形及用戶接口16.1 widget Tools包16.2 tk Widgets包16.3 geneplotter包16.4 hexbin包16.5 limma GUI包16.6 affylm GUI包16.7 webbioc包第17章 圖結構17.1 graph包17.2 RGBL包17.3 Rgraphviz包17.4 SNAData數(shù)據(jù)包第18章 通用工具18.1 repos Tools包18.2 Biobase包18.3 Biostrings包18.4 DynDoc包18.5 Ruuid包18.6 ctc包18.7 convert包18.8 Icens包18.9 expr External和external Vector軟件包第19章 注釋19.1 annotate包19.2 AnnBuilder包19.3 Resourcer包19.4 SNPtools包19.5 Data packages包第20章 基因本體學20.1 go Tools包20.2 onto Tools包20.3 GO stats包第21章 微陣列數(shù)據(jù)預處理21.1 affy包21.2 affycomp包21.3 affydata包21.4 affypdnn包21.5 affyPLM包21.6 gcrma包21.7 makecdfenv包21.8 annaffy包21.9 marray包21.10 matchprobes包21.11 vsn包第22章 數(shù)據(jù)分析22.1 daMA包22.2 edd包22.3 factDesign包22.4 genefilter包22.5 globaltest包22.6 gpls包22.7 multtest包22.8 pamr包22.9 Measurement Error.cor包22.10 limma包22.11 ROC包22.12 siggenes包22.13 splicegear包22.14 RMAGEML包第23章 微陣列比較基因組雜交23.1 aCGH包23.2 DNAcopy包第24章 蛋白質組學24.1 PROcess包24.2 gpls包24.3 apComplex包主要參考文獻附錄 R語言常用功能一覽表
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