被網(wǎng)絡(luò)層層包裹的地球，電子和光子交織穿梭。海岸的一角，陰險的“索拉太科”計劃啟動，目標瞄準全世界的電腦城市。電腦城市的中樞——新港市，即將迎來滅頂之災(zāi)，保衛(wèi)新港市的任務(wù)進入倒計時……
詳細簡介：
2029年6月，結(jié)束世紀大戰(zhàn)后的地球，已經(jīng)被網(wǎng)絡(luò)所覆蓋，企業(yè)之間的網(wǎng)絡(luò)將地球?qū)訉影�，電子和光子交織穿梭的信息化尚未使國家和民族消亡，然而人類的�?gòu)成產(chǎn)生了很大變化：生化人、仿生人、人類共存在地球上，單憑肉眼無法識別。如何定義人類？對自身意識產(chǎn)生的疑問，使城市到處潛伏暴動、顛覆、反抗的危機。電腦都市的中樞，新港市，成為高科技包裝下的新型電子城市。
生化人——許多保存著人類靈魂和軀體但內(nèi)部卻是由機械組成的人，像普通人一樣生活在城市里。攻殼機動隊長素子，一名勇敢的女戰(zhàn)士，忍受機械帶來的變化，成為反恐力量的支柱。作為一個改造人她被賦予了許多高超的能力。但她卻因為同時具有機械能力和人類靈魂而感到深深的迷惑和懷疑，不知該把自己處于生命的何種位置。
故事開始前一周，素子所帶領(lǐng)的攻殼機動隊接受一個神秘的任務(wù)，在隊員負傷后，大家才發(fā)現(xiàn)，這不過是個實習(xí)，更艱巨的任務(wù)即將到來。一周后，素子艷裝出席宴會，會上主角——以發(fā)展太陽能源為主要目的“索拉太科”計劃首腦——米斯塔拉爾，成為她的關(guān)注焦點，兩人惺惺相惜。但是“索拉太科”的終極目的卻是從空中直接發(fā)射點對點高能量光線從而摧毀任何物品，包括整個城市。
素子在調(diào)查中失手被抓，無意中發(fā)現(xiàn)米斯塔拉爾竟然是國家機構(gòu)制造出的高級仿生人，因為過于智能導(dǎo)致失控，政府官員為避免下臺而任由米斯塔拉爾恣意行動。素子更獲知驚人內(nèi)幕：米斯塔拉爾的DNA提供者，竟然是位命運凄慘的小男孩——世紀大戰(zhàn)后政府需要器官修補戰(zhàn)士的軀體，他的家人被政府組織摘除器官致死。小男孩被粉碎實體，他的DNA卻保存下悲慘記憶，于是米斯塔拉爾成為政府暴行的代價。
充滿正義感的素子和勇猛的巴特以及聰明的隊員們，在具有學(xué)習(xí)和交流智慧的戰(zhàn)車——弗奇科馬的幫助下終將毀滅都市的危機清除。然而，素子頭腦中的憂郁和迷茫更加劇了……自己到底在保衛(wèi)誰？
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