《雕菰樓經學九種》，由《周易補疏》二卷、《尚書補疏》（《尚書孔氏傳補疏》）二卷、《毛詩補疏》五卷、《禮記補疏》（《禮記鄭氏注補疏》）三卷、《春秋左傳補疏》（《左氏春秋傳杜氏集解補疏》）五卷、《論語補疏》（《論語何氏集解補疏》）三卷、《孟子正義》三十卷、《禹貢鄭注釋》二卷、《群經宮室圖》二卷等九種書組成，共五十四卷�，F將上述“九種”的主要版本情況筒述如下：
收錄于清嘉慶、道光年間刊刻的《焦氏叢書》本。
收錄于清光緒二年（一八七六）衡陽魏氏重刊的《焦氏遺書》本。
收錄于清道光五年（一八二五）阮元刊刻的《皇清經解》本。
收錄于清咸豐十年（一八六〇）勞崇光刊刻的《皇清經解》補刊本（南菁書院本）。
收錄于清光緒十四年（一八八八）王先謙刊刻的《皇清經解續(xù)編》本。
收錄于臺灣文海出版社據清嘉慶間手稿影印的《雕菰樓經學叢書》本。
《雕菰樓經學九種》中，《禹貢鄭注釋》的稿本，現藏天津市圖書館�！度航浌偈覉D》又有半九書塾刻本，昊鼎、李慈銘跋，現藏國家圖書館。孫誥讓批校本，現藏溫州市圖書館�！睹献诱x》的稿本，現藏國家圖書館。又清道光刻本，謝章鍵校，現藏福建省圖書館。又世界書局《諸子集成本》，存十四卷。中華書局據學海堂經解排印本�！睹献友a疏》二卷，稿本現藏國家圖書館等等。
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